Сертификаты КЭП ФТС предназначены для работы в различных информационных системах ФТС, к которым, в том числе, относятся портал ФТС, а также информационные системы операторов, с которыми у ЦИТТУ ФТС заключены соглашения об информационном взаимодействии при представлении сведений в электронной форме с использованием международной ассоциации сетей «Интернет». Подтверждением того, что УЦ СКБ Контур уполномочен выдавать сертификаты КЭП для работы с информационными системами ФТС, является наличие УЦ в списке Доверенных УЦ.