Под депозитарным хранилищем понимается комплекс инженерных сооружений, созданных для обеспечения физической сохранности и безопасности образцов.

Решение о создании депозитарного хранилища принимается Правительством РФ. В решении определяется национальный центр генетических ресурсов, на базе которого создается депозитарное хранилище.

Обязательными условиями функционирования депозитарного хранилища являются: обеспечение автономного энергоснабжения; транспортная доступность, включающая автодорожные, железнодорожные и водные пути; обеспечение температурного режима размещения единиц хранения образцов растений, сельскохозяйственных животных и микроорганизмов в соответствии с типами коллекций.

В ходе функционирования и эксплуатации депозитарного хранилища должны соблюдаться устанавливаемые Правительством РФ требования к обеспечению безопасности и защиты объектов (территорий) в целях надлежащего создания, формирования, сохранения, развития, изучения и использования биологических (биоресурсных) коллекций, включая требования к физической защите биологических (биоресурсных) коллекций в том числе от несанкционированного доступа к паспорту безопасности таких объектов (территорий).